摘 要: 細(xì)胞穿透環(huán)肽能夠穿透細(xì)胞膜,特異性地靶向細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo),并具有較好的體內(nèi)穩(wěn)定性,因而具備很好的成藥性,并受到研究者越來越多的關(guān)注。目前,主要有兩種方式獲得細(xì)胞穿透環(huán)肽,即從天然產(chǎn)物中獲得和對(duì)已有的環(huán)肽或線性肽進(jìn)行化學(xué)修飾。本文主要對(duì)上述兩方面進(jìn)行簡要綜述,重點(diǎn)介紹兩類細(xì)胞穿透環(huán)肽天然產(chǎn)物以及通過化學(xué)修飾方法得到細(xì)胞穿透環(huán)肽的策略,并探討細(xì)胞穿透環(huán)肽的結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系及其細(xì)胞穿透機(jī)理。
多肽類藥物是新興的生物藥物研發(fā)熱門領(lǐng)域,全世界已經(jīng)獲批上市的多肽類藥物超過 50 個(gè)。與小分子藥物比較[1,2],多肽類藥物具有結(jié)合面更大、作用靶向性更強(qiáng)、更安全、副作用更小、很少引起嚴(yán)重的免疫反應(yīng)等優(yōu)點(diǎn)[3,4],已經(jīng)廣泛應(yīng)用于癌癥、心血管病、代謝類和傳染性病等各類疾病的治療。
但是,常見的多肽分子存在無法跨越細(xì)胞膜,酶解穩(wěn)定性差和口服生物利用度低等問題[5],導(dǎo)致大多數(shù)具有治療作用的多肽藥物很難進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮藥效,且容易在體內(nèi)降解[6],因此,多肽藥物在實(shí)際應(yīng)用中受到了極大的限制。為了克服多肽藥物存在的問題,人們發(fā)現(xiàn)并發(fā)展了一類細(xì)胞穿透環(huán)肽分子,它們具有穿過細(xì)胞膜的能力,并能特異性地靶向細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo),體內(nèi)穩(wěn)定性高,口服生物利用度好,更具成藥前景。另一方面,蛋白化學(xué)合成領(lǐng)域取得的一系列重要進(jìn)展[7 ~ 15],促進(jìn)研究者發(fā)展了一系列化學(xué)合成環(huán)肽的方法[16 ~ 20],為研究和改造環(huán)肽從而得到細(xì)胞穿透環(huán)肽奠定了技術(shù)基礎(chǔ),有效解決了細(xì)胞穿透環(huán)肽分子的獲取問題。
本文重點(diǎn)介紹目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞穿透環(huán)肽及其透膜機(jī)理,同時(shí)也簡述各種獲得細(xì)胞穿透環(huán)肽的化學(xué)修飾策略,最后討論該領(lǐng)域存在的問題,并展望細(xì)胞穿透環(huán)肽的應(yīng)用前景。
2 天然產(chǎn)物中的細(xì)胞穿透環(huán)肽
環(huán)肽是自然界中一類廣泛存在的天然產(chǎn)物,可以通過核糖體或非核糖體途徑合成,具有抗菌、鎮(zhèn)痛、抗腫瘤、抗免疫等生理作用。其中,某些環(huán)肽具有穿透細(xì)胞膜的能力,即本文所述的細(xì)胞穿透環(huán)肽環(huán)孢素( cyclosporine A)和植物環(huán)肽( cyclotides)。
研究表明,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)的植物環(huán)肽來源的 4 個(gè)細(xì)胞穿透環(huán)肽的跨膜機(jī)理各不相同。MCoTI-Ⅱ通過細(xì)胞主動(dòng)攝取的方式進(jìn)入細(xì)胞。熒光成像跟蹤技術(shù)表明,MCoTI-Ⅱ出現(xiàn)在吞噬小體中,并且細(xì)胞攝取過程對(duì)溫度敏感,說明 MCoTI-Ⅱ 的跨膜過 程 是 主 動(dòng) 過程,需要消耗能量[36]。MCoTI-Ⅰ的跨膜機(jī)理則較為復(fù)雜,是流體相內(nèi)吞作用( fluid-phase endocytosis)、依賴脂質(zhì)的內(nèi)吞作用和網(wǎng)格蛋白介導(dǎo)的內(nèi)吞作用等共同作用的結(jié)果[35]。而植物環(huán)肽 kalata B1 有細(xì)胞毒性,超過一定濃度時(shí)會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞膜破裂,引起細(xì)胞死 亡。實(shí) 驗(yàn) 發(fā) 現(xiàn),kalata B1 和 磷 脂 酰 乙 醇 胺( POPE ) 有 相 互 作 用,可 以 引 起 POPE 外 翻( transbilayer movement),從而導(dǎo)致細(xì)胞膜兩側(cè)的不對(duì)稱。Craik 等猜測 kalata B1 通過與細(xì)胞膜的相互作用,改變細(xì)胞膜的曲率,從而引起細(xì)胞的內(nèi)吞作用[36]。另一方面,kalata B1 與細(xì)胞膜的親和性與脂筏相關(guān),帶負(fù)電的膽堿并不是細(xì)胞膜與 kalata B1 發(fā)生強(qiáng)相互作用的原因[37]。
植物環(huán)肽細(xì)胞穿透過程的研究還處于較初級(jí)的階段。一方面,其結(jié)構(gòu)在跨膜過程中的作用還不夠明確。在研究植物環(huán)肽的跨膜過程時(shí),實(shí)驗(yàn)條件的差異會(huì)導(dǎo)致不同的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。比如實(shí)驗(yàn)中選擇的細(xì)胞系對(duì)內(nèi)吞方式的偏好程度不同、所用植物環(huán)肽的濃度不同等,都會(huì)對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。同時(shí),當(dāng)前只能通過改變殘基的方式來探究各個(gè)位點(diǎn)對(duì)整個(gè)跨膜過程的貢獻(xiàn),還無法實(shí)時(shí)監(jiān)測環(huán)肽的構(gòu)象變化對(duì)跨膜過程的影響。另外,對(duì)跨膜過程中的細(xì)胞吞噬行為的理解十分有限。除對(duì)網(wǎng)格蛋白介導(dǎo)的吞噬作用和細(xì)胞膜窩樣內(nèi)陷( caveolae) 介導(dǎo)的吞噬作用理解較多外,生物學(xué)家對(duì)其他類型的細(xì)胞內(nèi)吞行為的理解并不深入。這也阻礙了研究者對(duì)植物環(huán)肽跨膜過程的進(jìn)一步理解。因此,發(fā)展新型技術(shù)研究植物環(huán)肽跨膜特性的結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系仍是一個(gè)尚待解決的科學(xué)問題。
3 人工改造的細(xì)胞穿透環(huán)肽
細(xì)胞穿透環(huán)肽具有很好的成藥前景,這促使研究者利用化學(xué)合成手段對(duì)多肽分子進(jìn)行改造,以期獲得兼具強(qiáng)生理活性和跨膜能力的環(huán)肽分子,甚至環(huán)肽庫。下面將從 CSA 的改造、植物環(huán)肽的改造和線性肽環(huán)化等三方面策略進(jìn)行介紹。
基于 CSA 的細(xì)胞穿透環(huán)肽的設(shè)計(jì)思路包括調(diào)節(jié)環(huán)肽的構(gòu)象和多肽骨架酰胺 N-甲基化兩方面。
為了更加定量地研究并預(yù)測環(huán)肽被動(dòng)擴(kuò)散跨膜的能力,Lokey 和 Jacobson 等提出了一種新的預(yù)測方法[42]。假設(shè)環(huán)肽在細(xì)胞膜中的構(gòu)象(低介電環(huán)境構(gòu)象 low-dielectric conformation,LDC) 只有一種,他們指出,經(jīng)典的擴(kuò)散模型 Pe = KpD / d 中的 Kp應(yīng)理解為 LDC 在細(xì)胞膜和水相中的分配系數(shù),而不是通常實(shí)驗(yàn)所測得的所有構(gòu)象下的平均值。他們提出,可以通過分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算得到 ΔGI ( 利用公式 ΔGI =- RTlnKp ),從而可以理論計(jì)算出滲透率。他們指出,這個(gè)模型的預(yù)測能力比預(yù)測氫鍵數(shù)目和預(yù)測極性表面積更加準(zhǔn)確。盡管他們計(jì)算出的 ΔGI和實(shí)驗(yàn)測得的 lnPe呈線性關(guān)系,但比例系數(shù)卻并不一致,因?yàn)橛?jì)算中沒有考慮熵效應(yīng);另外,環(huán)肽分子尺寸和形狀等因素也沒有考慮在內(nèi),并且實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證量很小,其模型的正確性還有待檢驗(yàn)。
對(duì)經(jīng)被動(dòng)擴(kuò)散跨膜的環(huán)肽而言,預(yù)測并通過化學(xué)修飾的方法改變 LDC 構(gòu)象,從而減小環(huán)肽從水相向細(xì)胞膜遷移中的吉布斯自由能變是研究的關(guān)鍵點(diǎn)。所以,認(rèn)識(shí)化學(xué)修飾對(duì)環(huán)肽構(gòu)象的影響是其中重要的科學(xué)問題。然而,在現(xiàn)有的被動(dòng)擴(kuò)散跨膜的環(huán)肽實(shí)例中,其殘基基本都是不帶電荷并且是非極性的,說明這種跨膜策略對(duì)氨基酸殘基的要求較高,對(duì)極性和帶電荷的殘基的容忍度較低。針對(duì)這個(gè)問題,可以適當(dāng)引入容忍度較大的非天然氨基酸以提高被動(dòng)擴(kuò)散策略下環(huán)肽的多樣性;另一方面,可以利用細(xì)胞內(nèi)外 pH 或酶活性的差異,設(shè)計(jì) pH 響應(yīng)或酶響應(yīng)殘基,在細(xì)胞外其極性被掩蔽,在細(xì)胞內(nèi)去掩蔽,激活環(huán)肽的正常生理活性。
除了多肽構(gòu)象變化對(duì)跨膜能力有貢獻(xiàn),多肽骨架的酰胺 N-甲基化對(duì)跨膜能力也有影響。骨架酰胺 N-甲基化修飾在天然產(chǎn)物中很常見。在特定位置引入 N-甲基可以增強(qiáng)多肽與受體間的相互作用、增強(qiáng)多 肽 對(duì) 靶 標(biāo) 的 選 擇 性 或 改 變 蛋 白 的 聚 集 行為[43 ~ 45]。
以上工作表明,N-甲基化可以通過改變環(huán)肽在水相中的構(gòu)象來提高其跨膜能力。在前人工作的基礎(chǔ)上,Kessler 等系統(tǒng)地研究了 N-甲基化對(duì)環(huán)肽構(gòu)象的影響[50]。他們選擇環(huán)六肽 cyclo( -D-Ala-Ala5 -) 作為研究對(duì)象,分析不同 N-甲基化衍生物在水相中的二維核磁結(jié)構(gòu)。他們認(rèn)為 N-甲基化會(huì)從以下三方面影響環(huán)肽 β-轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)的形成,從而導(dǎo)致跨環(huán)分子內(nèi)氫鍵的出現(xiàn): ( 1 ) 肽鍵的順、反式; ( 2 ) 對(duì)骨架上N—H 氫鍵的掩蔽作用;(3 ) 扭曲環(huán)肽原本的結(jié)構(gòu)。他們發(fā)現(xiàn),實(shí)驗(yàn)中所得到的一些典型的 β-轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)在前人 發(fā) 現(xiàn) 的 N-甲 基 化 細(xì) 胞 穿 透 環(huán) 肽 中 有 對(duì) 應(yīng)物[22,4 6 ,47]。另外,他們指出某些結(jié)構(gòu)特殊的氨基酸可以起到在環(huán)肽中引入 N-甲基化或 D-型構(gòu)象的作用,例如 α-N 甲基化的脯氨酸和具有對(duì)稱性的甘氨酸。
以上這些發(fā)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞穿透環(huán)肽的設(shè)計(jì)有指導(dǎo)作用,但是其中仍存在一些問題。比如,研究系統(tǒng)多是環(huán)六肽,所以無法知曉當(dāng)環(huán)增大后,跨環(huán)氫鍵與 N-甲基化之間具有怎樣的協(xié)同或其他相互影響。同時(shí),其他位置 N-甲基化對(duì) β-轉(zhuǎn)角的形成有怎樣的影響也不明了;同時(shí),環(huán)增大后,基于篩選的 N-甲基化策略將變得更為困難,因?yàn)樾枰铣傻难苌飻?shù)量呈指數(shù)上升。所以,需要發(fā)展可以快速得到大量細(xì)胞穿 透 環(huán) 肽 的 N-甲 基 化 修 飾 方 法。Jacobson 和Lokey 等[49]報(bào)道的選擇性甲基化的工作對(duì)此具有一定啟發(fā)性,但是距離目標(biāo)實(shí)現(xiàn)還有較大差距。
雖然目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些植物環(huán)肽可以通過細(xì)胞膜,并且其中的某些環(huán)肽如 MCoTI 和 Kalata B 作為多肽骨架被用于嫁接多肽的研究,但是由于植物環(huán)肽的跨膜方式多為細(xì)胞主動(dòng)攝取,需要消耗能量,并且過程復(fù)雜,機(jī)理不明。同時(shí),其過程不像被動(dòng)擴(kuò)散一樣廣泛存在于小分子藥中。因此,植物環(huán)肽跨膜效率仍不明確,對(duì)不同細(xì)胞的耐受度也不清楚。故而,需要進(jìn)一步搞清介導(dǎo)植物環(huán)肽跨膜的分子機(jī)制;同時(shí),還需要系統(tǒng)地研究可以進(jìn)入細(xì)胞膜的植物環(huán)肽在人體內(nèi)的藥代動(dòng)力學(xué),搞清其跨膜效率及在體內(nèi)的分布狀況。在對(duì)植物環(huán)肽的跨膜結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和藥代動(dòng)力學(xué)認(rèn)識(shí)深入后,可利用化學(xué)手段優(yōu)化環(huán)肽結(jié)構(gòu),使其在體內(nèi)的行為更符合成藥的要求。
為使線性肽環(huán)化后得到環(huán)肽具有細(xì)胞穿透能力,通常使用的策略包括側(cè)鏈環(huán)化的“訂書肽”策略和在環(huán)肽中引入細(xì)胞穿透序列。
細(xì)胞穿透肽 ( cell penetrating peptides,CPP) 是一 類 能 夠 穿 過 細(xì) 胞 膜 的 線 性 肽,包 括 穿 膜 肽( penetratin )[60]、轉(zhuǎn) 錄 激 活 因 子 ( trans-activator oftranscription,Tat ) 片 段[61]、Pep-1[62]、多 精 氨 酸( polyarginines)[63] 等。CPP 可 以 通 過 細(xì) 胞 主 動(dòng) 攝取[64]或非能量依賴的轉(zhuǎn)運(yùn)過程[65,66]進(jìn)入細(xì)胞,并能將與之共價(jià)或非共價(jià)連接的蛋白或核酸運(yùn)入細(xì)胞。細(xì)胞穿透肽常帶有相當(dāng)多的精氨酸,表面帶正電,能夠與細(xì)胞膜表面的負(fù)電荷發(fā)生靜電作用,增強(qiáng)與細(xì)胞膜的相互作用。這類多精氨酸的 CPP ( arginine richpeptides,RRP) 通過與細(xì)胞膜相互作用使細(xì)胞膜變薄,產(chǎn)生瞬時(shí)孔從而穿過細(xì)胞膜。利用 CPP 能夠?qū)⑴c其共價(jià)連接的分子帶入細(xì)胞的特點(diǎn),Pei 等將 CPP共價(jià)地連接到環(huán)肽分子上,成功實(shí)現(xiàn)了環(huán)肽分子跨膜[67]。但是,直接修飾的 RRP 分子細(xì)胞穿透能力差,有時(shí)具有細(xì)胞毒性,引起細(xì)胞壞死[68 ~ 70]。
4 結(jié)論
與普通線性多肽相比,細(xì)胞穿透環(huán)肽具有較好體內(nèi)穩(wěn)定性,并能夠穿過細(xì)胞膜而特異性結(jié)合細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo),具備很好的成藥性,因此細(xì)胞穿透環(huán)肽已經(jīng)成為當(dāng)前藥物研究的新熱點(diǎn)。本文從天然產(chǎn)物來源和人工改造來源兩方面綜述了細(xì)胞穿透環(huán)肽領(lǐng)域的研究進(jìn)展及發(fā)展前景。在化學(xué)合成獲得所需環(huán)肽分子的基礎(chǔ)上,我們?nèi)匀恍枰M(jìn)一步理解環(huán)肽分子的跨膜機(jī)理、環(huán)肽分子與受體或膜間相互作用的分子機(jī)制和具體過程,以設(shè)計(jì)、改造得到具有細(xì)胞穿透活性的環(huán)肽藥物。
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