一、PNA簡介
1、跟DNA、RNA相比，PNA 有2個最重要的特點是：
1）跟對應的核酸結合，Tm 值高，穩(wěn)定性強。
2）跟對應核酸序列結合，特異性非常高：完全配對時，Tm值比對應的DNA-DNA高；如果有一個堿基不配對，Tm 值會下降15℃左右，比對應的DNA-DNA Tm 值低；如果有2個堿基不配對，完全不能結合。 基于以上不同于DNA、RNA 的特性，PNA 為生命科學的研究及藥物開發(fā)提供了新的思路。
2、PNA特性&優(yōu)勢
強結合力：PNA是由電中性的酰胺骨架組成，因此PNA鏈與DNA鏈之間無排斥現象，因此，PNA與DNA之間具有更強的結合力。
強特異性及靈敏性：在不存在錯配的情況下，PNA/DNA結合穩(wěn)定性強于DNA/DNA；在錯配情況下，PNA/DNA結合穩(wěn)定性弱于DNA/DNA。即便是單個堿基錯配，也會造成溶解曲線的巨大差異。因此，可以區(qū)分單個堿基的錯配。沒出現1個堿基的錯配，Tm值平均降低15°C，如果2個堿基錯配，則完全不能雜交，因此特異性極高。
強穩(wěn)定性：PNA具有較強的化學，生物學，熱力學穩(wěn)定性。PNA在高溫，強PH條件下，均具有較強的穩(wěn)定性。并且由于PNA骨架有別于核酸以及多肽骨架，因此，核酸酶及蛋白酶均不易降解PNA。
強雜交穩(wěn)定性：PNA在高鹽濃度的雜交液中具有較強的穩(wěn)定性，以及結合力。因此，PNA可以作為比較穩(wěn)定的雜交探針應用于科學研究。在相同條件下，15個相同序列的堿基，DNA/DNA的Tm值為53.3°C，DNA/RNA的Tm值為50.6°C，PNA/DNA的Tm值高達69.5°C，PNA/PNA更是高達72.3°C，即與相同序列的天然核酸堿基序列相比，每增加1個堿基，解鏈溫度提高1°C，大大提高了雜交穩(wěn)定性。
強安全性：PNA幾乎沒有毒性，為小鼠經脈注射PNA，2h后觀察PNA存在于所有的組織器官中，而90%的PNA在用藥后24 h內以未經修飾的形式經尿排出，因此PNA對于生物體來說，具有很高的安全性。
二、PNA 設計及注意事項
1. 結合特性。雖然從理論上講，PNA可以從兩個方向來和目的片段形成雜交體，但實際上，最常見的是反向結合（ anti-parallel orientation）。PNA的N末端相當于寡核苷酸的5′端，因此也經常被稱為PNA的5′端。和普通的DNA/DNA雜交體相比較，PNA/DNA具有較高的Tm值。一般而言，在100mM NaCl的條件下，每個堿基對的Tm值會升高大約1°C。
2. 長度。由于PNA具有很高的親和力（higheraffinity），因此不需要設計很長的序列，一般而言12-18個已經足以滿足需要，這和其他常規(guī)25-40個寡核苷酸探針有著巨大的區(qū)別。我們必須要記得，序列越短，則其特異性就越高。對PNA而言，有時更短的序列也會達到預期的效果。反而長的PNA會發(fā)生聚集沉淀（aggregate），而影響下游的純化和分析。
3. 嘌呤含量。嘌呤含量高的PNA，特別是鳥嘌呤G,也容易發(fā)生聚集沉淀（aggregate）。所以，在任何10個連續(xù)的PNA單體中，不要有6個或者更多的嘌呤出現。因此，從這意義上講，越短的PNA序列，那么就越不需要擔心設計上出現問題。
4. 自身互補。盡量來防止自身互補（Self-complementarity）的發(fā)生。在序列設計上，避免反向重復（inverserepeats），發(fā)夾結構（hairpinforming），和回文序列（palindromic sequences）。
5. 改善溶解性。當 PNA 鏈較長（>22mer）或者嘌呤含量高（>60%） 時，為了提高 PNA 探針的溶解性，我們建議在序列中加入一些助溶基團如 O linker、E linker、X linker 或者兩個賴氨酸。當 PNA 偶聯(lián)多肽或染料時，接頭（linker） 可以起到空間間隔（spacer）的作用。
6. 標記 PNA。 PNA 鏈 5′ 端和 3′ 端均可以標記。由于 3′ 端是非活性基團（-CONH2），所以需加入一個賴氨酸，其側鏈上的氨基可以用來標記。如果在 5′ 端標記，我們建議在 PNA 和標記物之間加 1~2 O linkers。標記物：熒光基團（—NHS 酯或羧基酰胺）、生物素等。
三、PNA 的訂購
PNA的價格取決于序列長度、產量和修飾標記，請聯(lián)系我們的銷售人員。
最低訂購量： 未標記 PNA 50 nmole，標記PNA 25 nmole。
提供PNA的純度大于>95%，HPLC 純度分析報告、質譜分析報告，一般3~4周交貨。
