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信號(hào)肽優(yōu)化對(duì)重組抗體分泌表達(dá)的影響及研究進(jìn)展
瀏覽量:2922 | 2024/4/29 16:24:32


摘要:


重組抗體藥物在抗腫瘤、抗自身免疫病、抗感染等領(lǐng)域都有較好的應(yīng)用前景,且市場(chǎng)的需求量正在逐年上升。然而許多的抗體藥物在研究、生產(chǎn)過程中都面臨著產(chǎn)量低、穩(wěn)定性差、活性低等問題。目前,在大規(guī)模制備抗體藥物的過程中,常常利用動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)來生產(chǎn)分泌蛋白,而信號(hào)肽作為連接在分泌蛋白N端的一段氨基酸序列,能夠控制蛋白質(zhì)的分泌途徑進(jìn)而影響抗體蛋白的表達(dá)產(chǎn)量。簡(jiǎn)要概述了信號(hào)肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)與作用機(jī)制,同時(shí),指出其對(duì)重組抗體蛋白分泌效率的影響途徑,最后結(jié)合各種研究成果總結(jié)出信號(hào)肽序列優(yōu)化策略。

蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)形式主要有三種,包括經(jīng)典的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)高爾基體途徑分泌到細(xì)胞外、以可溶性蛋白留在細(xì)胞內(nèi)、以不可溶包涵體的形式留在細(xì)胞內(nèi)。在目前的抗體蛋白生產(chǎn)中,主要使用的表達(dá)方式為胞外分泌,因?yàn)榉置诔黾?xì)胞外的抗體不僅能以可溶性的活性結(jié)構(gòu)生產(chǎn),避免細(xì)胞內(nèi)酶蛋白的降解,同時(shí)也有利于下游的純化,降低復(fù)性的困難[1]。但在實(shí)際生產(chǎn)中,不僅常遇到所構(gòu)建載體的抗體蛋白不分泌或分泌量低等問題,而且也會(huì)出現(xiàn)所得抗體穩(wěn)定性差、活性低等急需解決的問題。其中一個(gè)解決方法就是通過融合一個(gè)合適的信號(hào)肽到目標(biāo)抗體的基因序列5′端?贵w的重鏈和輕鏈均需在信號(hào)肽的作用下進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)完成正確折疊和組裝,才能以有活性的形式分泌到胞外[2]。一般情況下,重組抗體的基因序列自身就帶有一段信號(hào)肽序列用于自身的分泌,但是在大多數(shù)情況下重新構(gòu)建的表達(dá)載體不能或低效率的利用抗體本身的信號(hào)肽序列,這時(shí)就需要重新篩選或?qū)υ行盘?hào)肽進(jìn)行優(yōu)化,可以達(dá)到提高重組抗體的分泌效率的目的。

1 重組抗體的研究進(jìn)展

抗體藥物的發(fā)展經(jīng)歷了鼠源單克隆抗體(McAb)、人-鼠嵌合抗體、人源化抗體和全人抗體等階段,在抗腫瘤、抗自身免疫病、抗感染及生物傳感器等領(lǐng)域都具有較好的應(yīng)用前景。隨著分子機(jī)制的深入發(fā)掘和抗體基因結(jié)構(gòu)的闡明,利用基因工程重組抗體蛋白、構(gòu)建抗體藥物偶聯(lián)物及哺乳動(dòng)物細(xì)胞大規(guī)模培養(yǎng)等生產(chǎn)技術(shù)推動(dòng)抗體工程進(jìn)入了一個(gè)全新的時(shí)代。統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),2010 年美國(guó)市場(chǎng)的單抗藥物銷售額為 185 億美元,世界范圍內(nèi)單抗藥物銷售額總計(jì)已達(dá) 400 多億美元,約是整個(gè)生物制藥市場(chǎng)份額的 36%[3]。發(fā)展至今,抗體藥物的生產(chǎn)主要通過基因工程的方法構(gòu)建體外表達(dá)載體來實(shí)現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn)的要求。由于重組單克隆抗體需要進(jìn)行翻譯后修飾(如糖基化修飾)、折疊及正確的切割或至少與人體內(nèi)獲得的相似,才能產(chǎn)生有活性,且降低免疫原性和細(xì)胞毒性的抗體藥物,因此一般需要在哺乳動(dòng)物細(xì)胞(如CHO)中大量生產(chǎn)[4, 5, 6]。與大腸桿菌相比,CHO等哺乳動(dòng)物細(xì)胞的表達(dá)水平低、細(xì)胞大規(guī)模培養(yǎng)的成本高,由此導(dǎo)致所生產(chǎn)的蛋白質(zhì)藥物成本較高。因此,設(shè)計(jì)與優(yōu)化體外表達(dá)載體是提高目的蛋白表達(dá)量的重要途徑之一,具體表現(xiàn)為將編碼細(xì)胞生長(zhǎng)刺激因子、抗凋亡因子及其他細(xì)胞生長(zhǎng)必需成分的基因加入表達(dá)載體,進(jìn)而敲入宿主基因,也可以通過在抗體信號(hào)肽基因3′端下游增加可供肽酶識(shí)別的位點(diǎn),達(dá)到提高蛋白質(zhì)分泌效率的目的[7]。常見的哺乳動(dòng)物商業(yè)化表達(dá)載體有pTandemTM、pTK-neo (Novagen)等。

2 信號(hào)肽結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制

Gunter Blobel 于20世紀(jì)70年代初提出了“信號(hào)假說”用以解決蛋白質(zhì)合成后的去向問題[8]。高等動(dòng)物體內(nèi)大多數(shù)分泌型蛋白通過 N 端的一段由15~30個(gè)氨基酸組成的與蛋白質(zhì)的分泌密切相關(guān)稱之為信號(hào)肽的氨基酸序列啟動(dòng)經(jīng)典的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)高爾基體途徑進(jìn)行分泌表達(dá)[9]。信號(hào)肽具有引導(dǎo)前體肽進(jìn)入粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)且通過分泌途徑分泌出胞外的作用。

2.1 信號(hào)肽一級(jí)結(jié)構(gòu)

信號(hào)肽位于分泌蛋白的N端,一般由10~40個(gè)氨基酸殘基組成,并大致分為3個(gè)區(qū)段:①n區(qū)(n-region)為帶正電荷的氨基酸,如賴氨酸和精氨酸;②疏水區(qū)(h-region)由9個(gè)或更多的以中性氨基酸為主組成的疏水核心區(qū),能夠形成一段L螺旋結(jié)構(gòu),常見有亮氨酸、異亮氨酸等;③加工區(qū)(c-region)是信號(hào)肽酶切割信號(hào)肽的部位,由極性、小分子氨基酸(如甘氨酸、丙氨酸、絲氨酸等)組成。一般認(rèn)為疏水區(qū)氨基酸序列越長(zhǎng)、疏水性越強(qiáng)的蛋白質(zhì)分泌效率就越高,因此疏水區(qū)的長(zhǎng)度及疏水性對(duì)蛋白質(zhì)分泌十分重要[10, 11]。信號(hào)肽結(jié)構(gòu)如圖 1所示。


2.2 信號(hào)肽轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制

信號(hào)肽介導(dǎo)的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)可分為兩大類: 若某個(gè)蛋白質(zhì)的合成與轉(zhuǎn)運(yùn)是同時(shí)發(fā)生的,則屬于翻譯-轉(zhuǎn)運(yùn)同步機(jī)制; 如果蛋白質(zhì)從核糖體上釋放后才發(fā)生轉(zhuǎn)運(yùn),則屬于翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。

(1)翻譯共轉(zhuǎn)運(yùn)途徑[13]。核糖體串聯(lián)成聚核糖體,準(zhǔn)備合成蛋白質(zhì)→信號(hào)識(shí)別顆粒(SRP)識(shí)別并結(jié)合在核糖體上→在聚核糖體上,由mRNA開始合成信號(hào)肽→SRP識(shí)別信號(hào)肽并與之結(jié)合,多肽鏈合成暫時(shí)停止→SRP-信號(hào)肽-聚核糖體復(fù)合物與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上SRP受體及核糖體受體結(jié)合→暫時(shí)停止合成的多肽鏈恢復(fù)合成,新生肽鏈隨信號(hào)肽延伸,接著信號(hào)肽被膜內(nèi)側(cè)的信號(hào)肽酶水解,新生肽鏈繼續(xù)延伸,形成有高級(jí)結(jié)構(gòu)的成熟蛋白質(zhì)。翻譯共轉(zhuǎn)運(yùn)途徑如圖 2所示。
(2)翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制。特定條件下蛋白質(zhì)在其合成結(jié)束后才開始轉(zhuǎn)運(yùn),采用這種機(jī)制定位的蛋白質(zhì)一般都是可溶性蛋白質(zhì),它們有一段適度疏水的信號(hào)肽序列而使它們?cè)诤铣蓵r(shí)避開了 SRP 的識(shí)別。




3 信號(hào)肽對(duì)抗體蛋白分泌效率的影響

3.1 一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸組成

大量研究表明,對(duì)于動(dòng)物細(xì)胞而言,信號(hào)肽的疏水核心長(zhǎng)度和疏水性對(duì)于抗體蛋白的分泌效率至關(guān)重要[14, 15],強(qiáng)疏水性能夠高效引導(dǎo)新生肽的轉(zhuǎn)運(yùn)。有研究表明,在對(duì)全球熱門抗體藥物阿瓦斯汀(Avastin)的重鏈信號(hào)肽疏水核心區(qū)進(jìn)行一級(jí)結(jié)構(gòu)改造后,用新的疏水性較低的信號(hào)肽取代原有信號(hào)肽,由此造成阿瓦斯汀產(chǎn)量降低[16]。此外,研究酵母 PhoA 信號(hào)肽疏水核心Leu與Ala 的比值時(shí)發(fā)現(xiàn),當(dāng) Leu/Ala 為 6∶4 時(shí),前體蛋白分泌加工能力最高,在此比值附近,信號(hào)肽分泌加工能力隨疏水性的增強(qiáng)而提高[17]。

3.2 二級(jí)結(jié)構(gòu)的空間構(gòu)象

信號(hào)肽序列的二級(jí)空間構(gòu)象能夠與mRNA翻譯起始因子相結(jié)合,但過于復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)卻會(huì)引起翻譯阻遏效應(yīng)。研究表明,全人源化抗HBsAg抗體的原信號(hào)肽經(jīng)過優(yōu)化后二級(jí)結(jié)構(gòu)能量從原來的ΔG=-19.7kcal/mol降至ΔG=-15.9kcal/mol,最終優(yōu)化后的輕鏈信號(hào)肽序列蛋白質(zhì)表達(dá)量比原輕鏈信號(hào)肽序列表達(dá)載體高4~8倍[18]。

4 信號(hào)肽序列優(yōu)化策略

研究發(fā)現(xiàn),許多原核和真核細(xì)胞甚至不同物種間的信號(hào)肽在功能上是通用的,國(guó)外進(jìn)行基因表達(dá)所采用的分泌信號(hào)大致有以下幾種情況:①與表達(dá)蛋白質(zhì)同源的分泌信號(hào)肽;②與宿主表達(dá)細(xì)胞同源的分泌信號(hào)肽;③機(jī)體內(nèi)表達(dá)的分泌蛋白的分泌信號(hào)肽。不同物種間的信號(hào)肽都可以用于某一特定宿主細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)免疫球蛋白[19]。在動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)重組抗體蛋白時(shí)常用到的信號(hào)肽除了自身所攜帶的信號(hào)肽還包括:①替換高效表達(dá)蛋白質(zhì)的信號(hào)肽序列作為重組抗體的信號(hào)肽,如乳蛋白中的酪蛋白或血清白蛋白的信號(hào)肽序列等,因?yàn)檫@些蛋白質(zhì)能在細(xì)胞中被高效分泌;②對(duì)原有抗體信號(hào)肽序列進(jìn)行一級(jí)結(jié)構(gòu)改造;③替換某些病毒的蛋白質(zhì)信號(hào)肽序列。

4.1 替換高效分泌蛋白的信號(hào)肽

當(dāng)所構(gòu)建的細(xì)胞株無法利用自身的天然信號(hào)肽獲得高表達(dá)分泌目標(biāo)抗體時(shí),利用高表達(dá)蛋白質(zhì)的信號(hào)肽替代原信號(hào)肽可以提高目標(biāo)抗體的表達(dá)量,往往同一物種的信號(hào)肽比其他物種的信號(hào)肽表達(dá)量要更高[7]。研究表明,α因子信號(hào)肽對(duì)引導(dǎo)小分子質(zhì)量的蛋白的分泌很有效,如表皮生長(zhǎng)因子,單鏈抗體Fv片段等利用α因子信號(hào)肽獲得了較理想的表達(dá)量。Lars等[20]應(yīng)用CHO細(xì)胞證明,與來自不同物種的或天然免疫球蛋白G信號(hào)肽衍生的信號(hào)肽相比,白蛋白和天青殺素的天然信號(hào)肽介導(dǎo)了抗體的最佳表達(dá)。

4.2 改造信號(hào)肽一級(jí)結(jié)構(gòu)

信號(hào)肽一級(jí)結(jié)構(gòu)中存在3個(gè)功能區(qū),根據(jù)研究報(bào)道,增加芽孢桿菌信號(hào)肽N端的正電荷或增加信號(hào)肽疏水核心h區(qū)的疏水性或長(zhǎng)度有利于提高信號(hào)肽的加工效率,信號(hào)肽C端氨基酸殘基的缺失使H區(qū)更靠近切割位點(diǎn),可能有利于蛋白質(zhì)的易位;而增加信號(hào)肽C端的極性,則可能會(huì)使信號(hào)肽的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,降低其加工效率[21]。

4.3 考慮宿主密碼子偏愛性

編碼同一種氨基酸的密碼子稱為同義密碼子,蛋白質(zhì)合成過程中,同義密碼子的使用概率并不相同,某一物種或某一基因通常傾向于使用一種或幾種特定的同義密碼子,即為密碼子的偏愛性[22, 23]。各種生物的密碼子使用并不是隨機(jī)的,而有一定的偏愛性,在選擇信號(hào)肽時(shí),應(yīng)考慮到該表達(dá)宿主相應(yīng)的偏愛密碼子,再進(jìn)行信號(hào)肽的優(yōu)化。Valent等使用偏愛密碼子的信號(hào)肽所得目標(biāo)蛋白產(chǎn)量更高,穩(wěn)定性也較天然信號(hào)肽好[23]。Jalah等對(duì)1L-15的天然信號(hào)肽進(jìn)行優(yōu)化時(shí),聯(lián)合使用偏愛密碼子,使得1L-15的表達(dá)水平提高了近100倍[24]。

4.4 使用某些病毒表達(dá)載體所帶的信號(hào)肽序列

某些病毒的表達(dá)蛋白是高分泌蛋白,如昆蟲桿狀病毒表達(dá)載體和丙型肝炎病毒系統(tǒng)表達(dá)外源基因的表達(dá)量高,而且能完成真核基因產(chǎn)物必要的轉(zhuǎn)錄后加工修飾[25]。但是在表達(dá)抗體藥物時(shí)一般不會(huì)使用病毒載體,因?yàn)槠浒踩詿o法得到保障。

5 小 結(jié)

基于信號(hào)肽的功能對(duì)重組抗體分泌具有重要的作用,對(duì)于其的應(yīng)用也越來越廣泛。通過添加一段合適的信號(hào)肽序列來引導(dǎo)重組抗體的分泌不僅可以實(shí)現(xiàn)提高分泌效率和簡(jiǎn)化下游的純化過程,而且對(duì)抗體的穩(wěn)定性和活性都具有積極的作用,當(dāng)然信號(hào)肽序列的選擇和優(yōu)化要根據(jù)不同的蛋白質(zhì)及表達(dá)系統(tǒng)來進(jìn)行。目前,高效的信號(hào)肽也正在不斷被研究和挖掘出來[26]。另外,可以利用在線工具進(jìn)行查詢和檢測(cè)信號(hào)肽序列,從基因組中快速地預(yù)測(cè)出信號(hào)肽[27],結(jié)果的可信度也比較高。例如,使用UTR Tailortech庫(kù)和SignalP及Tatp軟件等來預(yù)測(cè)篩選適合目的蛋白最佳分泌效率的信號(hào)肽[28, 29]。

展望未來,隨著抗體藥物的發(fā)展和進(jìn)步,關(guān)于提高重組抗體的表達(dá)量和穩(wěn)定性的研究會(huì)不斷的深入和發(fā)展,方法也會(huì)越來越多,而基于信號(hào)肽優(yōu)化的方法或策略將會(huì)很好地促進(jìn)上述研究。

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