如何選擇合適的熒光標記基團取決于您的實驗需求。藥理學實驗研究基本分為體內(nèi)研究和體外研究兩大類：
1、對于體內(nèi)研究：一般選擇發(fā)射波長在650-900nm的熒光基團，例如：ICG、Cy5.5和 Nile Blue。這是因為這類基團所發(fā)出的熒光具有較好的組織穿透能力，受背景干擾較小(水、血紅蛋白和脫氧血紅蛋白一般都會產(chǎn)生背景干擾吸收，其區(qū)域在560nm左右)。
2、對于體外研究：發(fā)射波長在400到600nm的熒光基團最為常用，例如：AMC、FITC和TAMRA。
3、熒光標記的多肽在現(xiàn)代醫(yī)學中的應用：例如：用Cy5.5標記的目標多肽研究對 c-Met受體的綁定作用。有人設計含有KSLSRHDHIHHH序列的cMBP，其C端為GGGSC， C端Cys用 Cy5.5-Maleimide標記其巰基側鏈。研究結果表明：上述Cy5.5-cMBP多肽與U87MG腫瘤細胞共孵24小時后，具有較高的癌細胞攝取值，其響應濃度在納摩爾級別。
